Mimarlık Fakültesi, Bakanlar Kurulu Kararıyla 8 Nisan 2016’da Balıkesir Üniversitesi Mühendislik-Mimarlık Fakültesinin kapatılarak, Mühendislik Fakültesi ve Mimarlık Fakültesi olarak iki ayrı Fakülte oluşturulmasıyla kurulmuştur ve aynı binada hizmet vermektedir.